Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THPOP40225 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THPOP40225 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
THPOP40225 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
THPOP40225 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
THPOP40225 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THPOP40225 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THPOP40225 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THPOP40225 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THPOP40225 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THPOP40225 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THPOP40225 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THPOP40225 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THPOP40225 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THPOP40225 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THPOP40225 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THPOP40225 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THPOP40225 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THPOP40225 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THPOP40225 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THPOP40225 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THPOP40225 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
THPOP40225 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THPOP40225 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THPOP40225 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THPOP40225 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THPOP40225 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THPOP40225 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THPOP40225 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
THPOP40225 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
THPOP40225 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
THPOP40225 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THPOP40225 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THPOP40225 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THPOP40225 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THPOP40225 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THPOP40225 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THPOP40225 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
THPOP40225 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THPOP40225 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
THPOP40225 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THPOP40225 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THPOP40225 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THPOP40225 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THPOP40225 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THPOP40225 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THPOP40225 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THPOP40225 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THPOP40225 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
THPOP40225 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THPOP40225 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THPOP40225 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THPOP40225 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THPOP40225 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THPOP40225 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THPOP40225 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
THPOP40225 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
THPOP40225 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THPOP40225 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THPOP40225 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THPOP40225 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THPOP40225 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THPOP40225 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THPOP40225 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
THPOP40225 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
THPOP40225 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THPOP40225 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THPOP40225 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THPOP40225 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
THPOP40225 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
THPOP40225 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
THPOP40225 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THPOP40225 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THPOP40225 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms