Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK1P39086 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK1P39086 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms