Protein–RNA interactions for Protein: P38915

SPT8, Transcription factor SPT8, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT8P38915 THI5YFL058W 1023 nt5.44□□□□□ -1.54
SPT8P38915 HXT4YHR092C 1731 nt5.44□□□□□ -1.54
SPT8P38915 REV7YIL139C 738 nt5.44□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YMR245WYMR245W 621 nt5.44□□□□□ -1.54
SPT8P38915 THI12YNL332W 1023 nt5.44□□□□□ -1.54
SPT8P38915 SOG2YOR353C 2376 nt5.44□□□□□ -1.54
SPT8P38915 JEM1YJL073W 1938 nt5.44□□□□□ -1.54
SPT8P38915 ADE13YLR359W 1449 nt5.43□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YHR095WYHR095W 495 nt5.43□□□□□ -1.54
SPT8P38915 SEC39YLR440C 2130 nt5.43□□□□□ -1.54
SPT8P38915 MEC3YLR288C 1425 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 MNN10YDR245W 1182 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 RPN12YFR052W 825 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 BGL2YGR282C 942 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 GON7YJL184W 372 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 ZPS1YOL154W 750 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 RCK1YGL158W 1539 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YJR015WYJR015W 1533 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YJR124CYJR124C 1347 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YHR182WYHR182W 2358 nt5.42□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YJL206CYJL206C 2277 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YDR417CYDR417C 372 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT8P38915 NSG1YHR133C 876 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT8P38915 SFT2YBL102W 648 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT8P38915 snR17bsnR17b 332 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT8P38915 PXA1YPL147W 2613 nt5.41□□□□□ -1.54
SPT8P38915 CAF4YKR036C 1932 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YFL064CYFL064C 525 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT8P38915 LDB18YLL049W 540 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT8P38915 ATP14YLR295C 375 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT8P38915 SER1YOR184W 1188 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT8P38915 YPR202WYPR202W 717 nt5.4□□□□□ -1.54
SPT8P38915 PMA1YGL008C 2757 nt5.4□□□□□ -1.55
SPT8P38915 VID30YGL227W 2877 nt5.4□□□□□ -1.55
SPT8P38915 ADE6YGR061C 4077 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT8P38915 ATG18YFR021W 1503 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT8P38915 FAU1YER183C 636 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT8P38915 TRX2YGR209C 315 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YLR283WYLR283W 945 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT8P38915 CSR1YLR380W 1227 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT8P38915 TLG2YOL018C 1194 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT8P38915 UBX7YBR273C 1311 nt5.39□□□□□ -1.55
SPT8P38915 APL6YGR261C 2430 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT8P38915 TUP1YCR084C 2142 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT8P38915 NOC4YPR144C 1659 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT8P38915 MID2YLR332W 1131 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT8P38915 TRS33YOR115C 807 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT8P38915 VHS2YIL135C 1311 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT8P38915 ARN1YHL040C 1884 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT8P38915 TDA7YNL176C 1911 nt5.38□□□□□ -1.55
SPT8P38915 MSH1YHR120W 2880 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT8P38915 AXL2YIL140W 2472 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YTA12YMR089C 2478 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT8P38915 IMA1YGR287C 1770 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT8P38915 CAX4YGR036C 720 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT8P38915 CBT1YKL208W 816 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YTA6YPL074W 2265 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT8P38915 PAN1YIR006C 4443 nt5.37□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YMR102CYMR102C 2505 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT8P38915 GAT4YIR013C 366 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT8P38915 KRE9YJL174W 831 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT8P38915 ERG3YLR056W 1098 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YCL041CYCL041C 495 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT8P38915 GCN20YFR009W 2259 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT8P38915 NDC1YML031W 1968 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 UBA2YDR390C 1911 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 UGA2YBR006W 1494 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 FUM1YPL262W 1467 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 ATG23YLR431C 1362 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 CAB4YGR277C 918 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 BUD28YLR062C 378 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 MRP21YBL090W 534 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 SSO1YPL232W 873 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 HSP26YBR072W 645 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 MRL1YPR079W 1146 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 CDC28YBR160W 897 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 CLF1YLR117C 2064 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT8P38915 MMT2YPL224C 1455 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT8P38915 ASA1YPR085C 1332 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YFR035CYFR035C 345 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT8P38915 PRM10YJL108C 1152 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YAR061WYAR061W 204 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT8P38915 MDG1YNL173C 1101 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT8P38915 YIL067CYIL067C 2037 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT8P38915 TFC7YOR110W 1308 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT8P38915 MCM4YPR019W 2802 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT8P38915 PEX7YDR142C 1128 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT8P38915 KRE6YPR159W 2163 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT8P38915 PRO2YOR323C 1371 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT8P38915 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT8P38915 YGR153WYGR153W 654 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT8P38915 YKL023WYKL023W 834 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT8P38915 YNL174WYNL174W 573 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT8P38915 TRM10YOL093W 882 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT8P38915 SMA1YPL027W 738 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT8P38915 GCR2YNL199C 1605 nt5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms