Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP62P37198 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP62P37198 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP62P37198 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP62P37198 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP62P37198 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP62P37198 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP62P37198 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP62P37198 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP62P37198 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP62P37198 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP62P37198 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP62P37198 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP62P37198 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP62P37198 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP62P37198 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP62P37198 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP62P37198 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP62P37198 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP62P37198 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP62P37198 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP62P37198 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP62P37198 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP62P37198 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP62P37198 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP62P37198 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP62P37198 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP62P37198 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP62P37198 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP62P37198 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP62P37198 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP62P37198 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP62P37198 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP62P37198 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP62P37198 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP62P37198 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP62P37198 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms