Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA7P36544 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA7P36544 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms