Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP6V1E1P36543 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATP6V1E1P36543 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.8 ms