Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 CUP1-1YHR053C 186 nt7.73□□□□□ -1.17
CSE4P36012 CUP1-2YHR055C 186 nt7.73□□□□□ -1.17
CSE4P36012 COA1YIL157C 594 nt7.73□□□□□ -1.17
CSE4P36012 DAN1YJR150C 897 nt7.73□□□□□ -1.17
CSE4P36012 CCP1YKR066C 1086 nt7.73□□□□□ -1.17
CSE4P36012 NIT3YLR351C 876 nt7.73□□□□□ -1.17
CSE4P36012 SPC2YML055W 537 nt7.73□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YPR071WYPR071W 636 nt7.73□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YPR177CYPR177C 372 nt7.73□□□□□ -1.17
CSE4P36012 ALG1YBR110W 1350 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 SRV2YNL138W 1581 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 snR56snR56 88 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 RML2YEL050C 1182 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 BMH1YER177W 804 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 PHB1YGR132C 864 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YHB1YGR234W 1200 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 CTF8YHR191C 402 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YKR051WYKR051W 1257 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 IRC25YLR021W 540 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YLR156WYLR156W 345 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YLR159WYLR159W 345 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YLR161WYLR161W 345 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 ANT1YPR128C 987 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 YML133CYML133C 4125 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 ECM7YLR443W 1347 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 SRO9YCL037C 1305 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 ICL2YPR006C 1728 nt7.72□□□□□ -1.17
CSE4P36012 MAL13YGR288W 1422 nt7.71□□□□□ -1.17
CSE4P36012 ADY2YCR010C 852 nt7.71□□□□□ -1.18
CSE4P36012 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.71□□□□□ -1.18
CSE4P36012 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.71□□□□□ -1.18
CSE4P36012 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.71□□□□□ -1.18
CSE4P36012 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.71□□□□□ -1.18
CSE4P36012 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.71□□□□□ -1.18
CSE4P36012 CMC1YKL137W 336 nt7.71□□□□□ -1.18
CSE4P36012 TGS1YPL157W 948 nt7.71□□□□□ -1.18
CSE4P36012 CSH1YBR161W 1131 nt7.71□□□□□ -1.18
CSE4P36012 SLX5YDL013W 1860 nt7.7□□□□□ -1.18
CSE4P36012 GUD1YDL238C 1470 nt7.7□□□□□ -1.18
CSE4P36012 VAC17YCL063W 1272 nt7.7□□□□□ -1.18
CSE4P36012 GPM2YDL021W 936 nt7.7□□□□□ -1.18
CSE4P36012 QCR6YFR033C 444 nt7.7□□□□□ -1.18
CSE4P36012 YGR022CYGR022C 330 nt7.7□□□□□ -1.18
CSE4P36012 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt7.7□□□□□ -1.18
CSE4P36012 EFM4YIL064W 774 nt7.7□□□□□ -1.18
CSE4P36012 ATG4YNL223W 1485 nt7.69□□□□□ -1.18
CSE4P36012 HAP2YGL237C 798 nt7.69□□□□□ -1.18
CSE4P36012 DMA1YHR115C 1251 nt7.69□□□□□ -1.18
CSE4P36012 YOR292CYOR292C 930 nt7.69□□□□□ -1.18
CSE4P36012 ATP20YPR020W 348 nt7.69□□□□□ -1.18
CSE4P36012 YPR142CYPR142C 564 nt7.69□□□□□ -1.18
CSE4P36012 SLD2YKL108W 1362 nt7.69□□□□□ -1.18
CSE4P36012 RSP5YER125W 2430 nt7.69□□□□□ -1.18
CSE4P36012 MTC1YJL123C 1437 nt7.69□□□□□ -1.18
CSE4P36012 YDR278CYDR278C 318 nt7.68□□□□□ -1.18
CSE4P36012 YFH7YFR007W 1062 nt7.68□□□□□ -1.18
CSE4P36012 BCY1YIL033C 1251 nt7.68□□□□□ -1.18
CSE4P36012 SIC1YLR079W 855 nt7.68□□□□□ -1.18
CSE4P36012 COG5YNL051W 1212 nt7.68□□□□□ -1.18
CSE4P36012 HST4YDR191W 1113 nt7.67□□□□□ -1.18
CSE4P36012 SPO19YPL130W 672 nt7.67□□□□□ -1.18
CSE4P36012 YBR144CYBR144C 315 nt7.67□□□□□ -1.18
CSE4P36012 PRR2YDL214C 2100 nt7.66□□□□□ -1.18
CSE4P36012 CPR1YDR155C 489 nt7.66□□□□□ -1.18
CSE4P36012 FZF1YGL254W 900 nt7.66□□□□□ -1.18
CSE4P36012 HGH1YGR187C 1185 nt7.66□□□□□ -1.18
CSE4P36012 SEC72YLR292C 582 nt7.66□□□□□ -1.18
CSE4P36012 MLF3YNL074C 1359 nt7.66□□□□□ -1.18
CSE4P36012 TOM71YHR117W 1920 nt7.66□□□□□ -1.18
CSE4P36012 GPB2YAL056W 2643 nt7.65□□□□□ -1.18
CSE4P36012 YDL023CYDL023C 321 nt7.65□□□□□ -1.18
CSE4P36012 UBC6YER100W 753 nt7.65□□□□□ -1.18
CSE4P36012 DAL3YIR032C 588 nt7.65□□□□□ -1.18
CSE4P36012 DCN1YLR128W 810 nt7.65□□□□□ -1.18
CSE4P36012 REH1YLR387C 1299 nt7.65□□□□□ -1.18
CSE4P36012 GLO4YOR040W 858 nt7.65□□□□□ -1.18
CSE4P36012 STE50YCL032W 1041 nt7.65□□□□□ -1.18
CSE4P36012 NDE1YMR145C 1683 nt7.64□□□□□ -1.19
CSE4P36012 ATR1YML116W 1629 nt7.64□□□□□ -1.19
CSE4P36012 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt7.64□□□□□ -1.19
CSE4P36012 VPS61YDR136C 573 nt7.64□□□□□ -1.19
CSE4P36012 DUS4YLR405W 1104 nt7.64□□□□□ -1.19
CSE4P36012 AIF1YNR074C 1137 nt7.64□□□□□ -1.19
CSE4P36012 YDR290WYDR290W 330 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 SYN8YAL014C 768 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 CBF1YJR060W 1056 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 YLR194CYLR194C 765 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 LST8YNL006W 912 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 FYV6YNL133C 522 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 ARG1YOL058W 1263 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 YOL118CYOL118C 309 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 ARR3YPR201W 1215 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 KKQ8YKL168C 2175 nt7.63□□□□□ -1.19
CSE4P36012 CNE1YAL058W 1509 nt7.62□□□□□ -1.19
CSE4P36012 RAV2YDR202C 1056 nt7.62□□□□□ -1.19
CSE4P36012 DDI2YFL061W 678 nt7.62□□□□□ -1.19
CSE4P36012 FMP48YGR052W 1110 nt7.62□□□□□ -1.19
CSE4P36012 RRP4YHR069C 1080 nt7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78.8 ms