Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP214P35658 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP214P35658 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NUP214P35658 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP214P35658 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP214P35658 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP214P35658 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP214P35658 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP214P35658 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP214P35658 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP214P35658 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP214P35658 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP214P35658 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP214P35658 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP214P35658 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP214P35658 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP214P35658 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP214P35658 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP214P35658 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP214P35658 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP214P35658 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP214P35658 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP214P35658 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP214P35658 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP214P35658 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP214P35658 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP214P35658 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP214P35658 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP214P35658 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP214P35658 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP214P35658 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP214P35658 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP214P35658 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP214P35658 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP214P35658 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP214P35658 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP214P35658 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP214P35658 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP214P35658 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms