Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPB2P35606 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB2P35606 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB2P35606 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB2P35606 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB2P35606 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB2P35606 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB2P35606 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB2P35606 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPB2P35606 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB2P35606 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB2P35606 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB2P35606 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB2P35606 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB2P35606 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB2P35606 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB2P35606 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB2P35606 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COPB2P35606 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPB2P35606 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPB2P35606 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPB2P35606 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB2P35606 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB2P35606 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB2P35606 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB2P35606 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB2P35606 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPB2P35606 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB2P35606 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB2P35606 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB2P35606 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB2P35606 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB2P35606 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPB2P35606 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COPB2P35606 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COPB2P35606 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COPB2P35606 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPB2P35606 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPB2P35606 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPB2P35606 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
COPB2P35606 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPB2P35606 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB2P35606 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB2P35606 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB2P35606 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB2P35606 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB2P35606 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB2P35606 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB2P35606 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
COPB2P35606 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPB2P35606 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPB2P35606 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB2P35606 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB2P35606 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB2P35606 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB2P35606 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB2P35606 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB2P35606 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB2P35606 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB2P35606 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPB2P35606 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COPB2P35606 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
COPB2P35606 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
COPB2P35606 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPB2P35606 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
COPB2P35606 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPB2P35606 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPB2P35606 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPB2P35606 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPB2P35606 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPB2P35606 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPB2P35606 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPB2P35606 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPB2P35606 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPB2P35606 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms