Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH5P33151 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH5P33151 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH5P33151 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH5P33151 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH5P33151 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH5P33151 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH5P33151 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH5P33151 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH5P33151 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH5P33151 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH5P33151 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH5P33151 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH5P33151 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH5P33151 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH5P33151 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH5P33151 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH5P33151 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH5P33151 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH5P33151 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH5P33151 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH5P33151 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH5P33151 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH5P33151 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH5P33151 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH5P33151 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH5P33151 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH5P33151 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH5P33151 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH5P33151 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH5P33151 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH5P33151 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH5P33151 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH5P33151 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH5P33151 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH5P33151 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH5P33151 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH5P33151 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH5P33151 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH5P33151 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH5P33151 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH5P33151 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH5P33151 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH5P33151 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH5P33151 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH5P33151 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH5P33151 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH5P33151 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH5P33151 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH5P33151 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH5P33151 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH5P33151 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH5P33151 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH5P33151 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH5P33151 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH5P33151 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH5P33151 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH5P33151 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH5P33151 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms