Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCR5P32302 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR5P32302 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms