Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX2P32243 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX2P32243 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX2P32243 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX2P32243 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX2P32243 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX2P32243 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX2P32243 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTX2P32243 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX2P32243 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX2P32243 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX2P32243 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX2P32243 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX2P32243 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX2P32243 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX2P32243 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX2P32243 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTX2P32243 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX2P32243 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX2P32243 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX2P32243 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX2P32243 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX2P32243 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX2P32243 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTX2P32243 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX2P32243 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX2P32243 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX2P32243 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX2P32243 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX2P32243 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX2P32243 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTX2P32243 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OTX2P32243 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX2P32243 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX2P32243 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX2P32243 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX2P32243 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX2P32243 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX2P32243 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX2P32243 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX2P32243 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTX2P32243 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTX2P32243 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX2P32243 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX2P32243 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX2P32243 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX2P32243 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX2P32243 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTX2P32243 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX2P32243 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX2P32243 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX2P32243 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX2P32243 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX2P32243 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX2P32243 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX2P32243 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX2P32243 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTX2P32243 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX2P32243 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX2P32243 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX2P32243 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX2P32243 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX2P32243 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX2P32243 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTX2P32243 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX2P32243 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX2P32243 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX2P32243 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX2P32243 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX2P32243 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX2P32243 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX2P32243 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX2P32243 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTX2P32243 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTX2P32243 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTX2P32243 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OTX2P32243 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTX2P32243 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTX2P32243 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTX2P32243 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTX2P32243 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX2P32243 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX2P32243 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX2P32243 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX2P32243 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX2P32243 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTX2P32243 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms