Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CLIP1P30622 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CLIP1P30622 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLIP1P30622 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms