Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTGFP29279 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTGFP29279 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTGFP29279 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTGFP29279 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTGFP29279 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTGFP29279 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTGFP29279 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTGFP29279 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTGFP29279 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTGFP29279 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CTGFP29279 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTGFP29279 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTGFP29279 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTGFP29279 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTGFP29279 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTGFP29279 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTGFP29279 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTGFP29279 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTGFP29279 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTGFP29279 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTGFP29279 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTGFP29279 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTGFP29279 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTGFP29279 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTGFP29279 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTGFP29279 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTGFP29279 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTGFP29279 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CTGFP29279 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTGFP29279 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTGFP29279 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTGFP29279 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CTGFP29279 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTGFP29279 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTGFP29279 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTGFP29279 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTGFP29279 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTGFP29279 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTGFP29279 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTGFP29279 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTGFP29279 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTGFP29279 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTGFP29279 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTGFP29279 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTGFP29279 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTGFP29279 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTGFP29279 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTGFP29279 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTGFP29279 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTGFP29279 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms