Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF8P28908 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFRSF8P28908 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF8P28908 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms