Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PEX2P28328 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PEX2P28328 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PEX2P28328 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PEX2P28328 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PEX2P28328 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX2P28328 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX2P28328 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX2P28328 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX2P28328 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PEX2P28328 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PEX2P28328 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX2P28328 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX2P28328 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX2P28328 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX2P28328 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX2P28328 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX2P28328 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PEX2P28328 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PEX2P28328 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX2P28328 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX2P28328 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX2P28328 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX2P28328 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX2P28328 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX2P28328 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX2P28328 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PEX2P28328 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PEX2P28328 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX2P28328 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX2P28328 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX2P28328 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX2P28328 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX2P28328 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PEX2P28328 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX2P28328 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX2P28328 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX2P28328 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PEX2P28328 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PEX2P28328 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PEX2P28328 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms