Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP5F1P24539 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP5F1P24539 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms