Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4BP23588 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF4BP23588 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF4BP23588 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms