Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EPHA1P21709 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EPHA1P21709 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms