Protein–RNA interactions for Protein: P20908

COL5A1, Collagen alpha-1(V) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1P20908 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL5A1P20908 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL5A1P20908 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms