Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDSP20132 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDSP20132 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SDSP20132 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SDSP20132 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDSP20132 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDSP20132 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDSP20132 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDSP20132 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDSP20132 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDSP20132 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDSP20132 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDSP20132 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDSP20132 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDSP20132 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDSP20132 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDSP20132 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDSP20132 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDSP20132 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDSP20132 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SDSP20132 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDSP20132 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDSP20132 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDSP20132 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDSP20132 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDSP20132 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SDSP20132 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDSP20132 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDSP20132 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SDSP20132 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDSP20132 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDSP20132 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDSP20132 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDSP20132 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDSP20132 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SDSP20132 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SDSP20132 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDSP20132 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDSP20132 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDSP20132 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDSP20132 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDSP20132 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SDSP20132 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDSP20132 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDSP20132 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDSP20132 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDSP20132 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDSP20132 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDSP20132 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDSP20132 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SDSP20132 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
SDSP20132 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDSP20132 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDSP20132 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDSP20132 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SDSP20132 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDSP20132 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDSP20132 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDSP20132 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDSP20132 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SDSP20132 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SDSP20132 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SDSP20132 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SDSP20132 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SDSP20132 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SDSP20132 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SDSP20132 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SDSP20132 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SDSP20132 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDSP20132 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms