Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFE3P19532 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFE3P19532 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFE3P19532 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFE3P19532 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFE3P19532 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFE3P19532 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFE3P19532 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFE3P19532 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TFE3P19532 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TFE3P19532 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFE3P19532 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFE3P19532 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFE3P19532 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TFE3P19532 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFE3P19532 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFE3P19532 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TFE3P19532 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFE3P19532 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFE3P19532 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFE3P19532 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFE3P19532 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFE3P19532 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFE3P19532 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFE3P19532 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFE3P19532 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFE3P19532 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFE3P19532 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFE3P19532 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TFE3P19532 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TFE3P19532 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFE3P19532 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFE3P19532 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFE3P19532 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFE3P19532 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFE3P19532 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFE3P19532 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFE3P19532 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TFE3P19532 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFE3P19532 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFE3P19532 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFE3P19532 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFE3P19532 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFE3P19532 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFE3P19532 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFE3P19532 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFE3P19532 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFE3P19532 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFE3P19532 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFE3P19532 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TFE3P19532 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFE3P19532 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFE3P19532 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFE3P19532 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFE3P19532 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFE3P19532 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFE3P19532 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFE3P19532 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TFE3P19532 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFE3P19532 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFE3P19532 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFE3P19532 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFE3P19532 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFE3P19532 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFE3P19532 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFE3P19532 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFE3P19532 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFE3P19532 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFE3P19532 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TFE3P19532 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms