Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF6P18850 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF6P18850 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF6P18850 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF6P18850 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATF6P18850 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF6P18850 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF6P18850 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF6P18850 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF6P18850 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF6P18850 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF6P18850 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF6P18850 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF6P18850 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF6P18850 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF6P18850 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF6P18850 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF6P18850 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF6P18850 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF6P18850 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF6P18850 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF6P18850 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF6P18850 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF6P18850 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF6P18850 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF6P18850 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF6P18850 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF6P18850 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF6P18850 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF6P18850 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF6P18850 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF6P18850 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF6P18850 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF6P18850 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF6P18850 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF6P18850 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms