Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATF3P18847 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATF3P18847 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATF3P18847 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATF3P18847 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ATF3P18847 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ATF3P18847 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ATF3P18847 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ATF3P18847 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATF3P18847 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATF3P18847 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATF3P18847 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ATF3P18847 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATF3P18847 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATF3P18847 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATF3P18847 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ATF3P18847 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATF3P18847 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATF3P18847 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ATF3P18847 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATF3P18847 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATF3P18847 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATF3P18847 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATF3P18847 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATF3P18847 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATF3P18847 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATF3P18847 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ATF3P18847 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATF3P18847 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATF3P18847 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATF3P18847 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATF3P18847 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATF3P18847 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATF3P18847 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATF3P18847 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATF3P18847 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ATF3P18847 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ATF3P18847 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ATF3P18847 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATF3P18847 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATF3P18847 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATF3P18847 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATF3P18847 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
ATF3P18847 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATF3P18847 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ATF3P18847 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATF3P18847 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATF3P18847 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ATF3P18847 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATF3P18847 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATF3P18847 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATF3P18847 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATF3P18847 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ATF3P18847 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ATF3P18847 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ATF3P18847 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATF3P18847 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ATF3P18847 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATF3P18847 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ATF3P18847 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ATF3P18847 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF3P18847 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF3P18847 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF3P18847 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF3P18847 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF3P18847 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ATF3P18847 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ATF3P18847 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATF3P18847 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATF3P18847 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATF3P18847 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ATF3P18847 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ATF3P18847 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ATF3P18847 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms