Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNB2P17787 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms