Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKMT2P17540 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CKMT2P17540 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CKMT2P17540 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms