Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL3L1P16619 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCL3L1P16619 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCL3L1P16619 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms