Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB42P16452 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB42P16452 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB42P16452 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB42P16452 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB42P16452 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB42P16452 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPB42P16452 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB42P16452 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB42P16452 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPB42P16452 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPB42P16452 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPB42P16452 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPB42P16452 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPB42P16452 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPB42P16452 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPB42P16452 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPB42P16452 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPB42P16452 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPB42P16452 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPB42P16452 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPB42P16452 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EPB42P16452 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPB42P16452 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPB42P16452 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPB42P16452 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPB42P16452 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB42P16452 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPB42P16452 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB42P16452 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB42P16452 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms