Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCK1P16333 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCK1P16333 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NCK1P16333 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NCK1P16333 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NCK1P16333 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NCK1P16333 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NCK1P16333 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCK1P16333 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCK1P16333 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCK1P16333 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCK1P16333 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCK1P16333 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCK1P16333 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NCK1P16333 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NCK1P16333 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCK1P16333 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCK1P16333 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCK1P16333 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCK1P16333 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCK1P16333 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCK1P16333 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NCK1P16333 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NCK1P16333 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCK1P16333 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NCK1P16333 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCK1P16333 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCK1P16333 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCK1P16333 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCK1P16333 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NCK1P16333 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NCK1P16333 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NCK1P16333 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.9 ms