Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDGFRAP16234 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms