Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPNP16150 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPNP16150 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPNP16150 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPNP16150 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPNP16150 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPNP16150 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPNP16150 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPNP16150 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPNP16150 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPNP16150 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPNP16150 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPNP16150 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPNP16150 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPNP16150 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPNP16150 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPNP16150 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPNP16150 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPNP16150 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPNP16150 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPNP16150 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPNP16150 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPNP16150 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPNP16150 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPNP16150 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPNP16150 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms