Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSPP15924 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSPP15924 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DSPP15924 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSPP15924 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSPP15924 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSPP15924 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSPP15924 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSPP15924 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DSPP15924 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSPP15924 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSPP15924 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSPP15924 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSPP15924 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSPP15924 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSPP15924 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DSPP15924 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSPP15924 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSPP15924 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSPP15924 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DSPP15924 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSPP15924 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSPP15924 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSPP15924 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DSPP15924 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DSPP15924 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DSPP15924 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSPP15924 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSPP15924 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DSPP15924 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSPP15924 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSPP15924 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DSPP15924 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSPP15924 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSPP15924 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSPP15924 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSPP15924 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSPP15924 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DSPP15924 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DSPP15924 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DSPP15924 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms