Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHN1P15882 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHN1P15882 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHN1P15882 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHN1P15882 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHN1P15882 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN1P15882 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN1P15882 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN1P15882 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN1P15882 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN1P15882 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN1P15882 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN1P15882 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN1P15882 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHN1P15882 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHN1P15882 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHN1P15882 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHN1P15882 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN1P15882 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN1P15882 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN1P15882 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN1P15882 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN1P15882 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHN1P15882 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN1P15882 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN1P15882 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN1P15882 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN1P15882 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN1P15882 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN1P15882 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHN1P15882 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN1P15882 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN1P15882 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN1P15882 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN1P15882 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN1P15882 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHN1P15882 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHN1P15882 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHN1P15882 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHN1P15882 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHN1P15882 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHN1P15882 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms