Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSF2RAP15509 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSF2RAP15509 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSF2RAP15509 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms