Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VAV1P15498 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VAV1P15498 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV1P15498 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV1P15498 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV1P15498 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV1P15498 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV1P15498 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV1P15498 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV1P15498 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV1P15498 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV1P15498 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV1P15498 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV1P15498 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV1P15498 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV1P15498 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV1P15498 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV1P15498 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV1P15498 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV1P15498 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV1P15498 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV1P15498 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV1P15498 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV1P15498 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV1P15498 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV1P15498 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV1P15498 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV1P15498 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV1P15498 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV1P15498 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV1P15498 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV1P15498 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV1P15498 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV1P15498 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV1P15498 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV1P15498 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV1P15498 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV1P15498 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV1P15498 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV1P15498 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAV1P15498 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAV1P15498 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAV1P15498 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAV1P15498 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV1P15498 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms