Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNT1P13805 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNT1P13805 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNNT1P13805 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms