Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAM1P13591 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCAM1P13591 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms