Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
COL11A1P12107 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL11A1P12107 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL11A1P12107 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL11A1P12107 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL11A1P12107 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL11A1P12107 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL11A1P12107 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL11A1P12107 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL11A1P12107 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms