Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARSP12081 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARSP12081 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARSP12081 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARSP12081 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HARSP12081 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARSP12081 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARSP12081 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARSP12081 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARSP12081 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HARSP12081 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARSP12081 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARSP12081 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARSP12081 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARSP12081 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARSP12081 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARSP12081 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARSP12081 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARSP12081 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HARSP12081 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HARSP12081 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HARSP12081 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HARSP12081 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HARSP12081 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HARSP12081 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HARSP12081 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARSP12081 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARSP12081 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARSP12081 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARSP12081 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HARSP12081 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HARSP12081 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HARSP12081 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HARSP12081 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HARSP12081 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HARSP12081 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HARSP12081 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HARSP12081 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HARSP12081 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HARSP12081 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HARSP12081 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HARSP12081 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HARSP12081 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HARSP12081 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HARSP12081 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms