Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MS4A1P11836 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MS4A1P11836 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MS4A1P11836 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MS4A1P11836 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MS4A1P11836 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MS4A1P11836 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MS4A1P11836 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms