Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF1P10914 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF1P10914 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF1P10914 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF1P10914 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF1P10914 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRF1P10914 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRF1P10914 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRF1P10914 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF1P10914 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF1P10914 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRF1P10914 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRF1P10914 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRF1P10914 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF1P10914 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF1P10914 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF1P10914 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF1P10914 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRF1P10914 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF1P10914 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF1P10914 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF1P10914 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF1P10914 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF1P10914 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF1P10914 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF1P10914 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF1P10914 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF1P10914 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF1P10914 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF1P10914 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF1P10914 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF1P10914 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF1P10914 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRF1P10914 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRF1P10914 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF1P10914 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF1P10914 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF1P10914 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF1P10914 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF1P10914 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF1P10914 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF1P10914 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF1P10914 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF1P10914 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF1P10914 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF1P10914 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF1P10914 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF1P10914 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.1 ms