Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFB3P10600 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFB3P10600 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms