Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GLI3P10071 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GLI3P10071 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GLI3P10071 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GLI3P10071 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GLI3P10071 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GLI3P10071 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GLI3P10071 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GLI3P10071 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GLI3P10071 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GLI3P10071 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GLI3P10071 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GLI3P10071 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GLI3P10071 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GLI3P10071 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GLI3P10071 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
GLI3P10071 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GLI3P10071 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GLI3P10071 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GLI3P10071 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GLI3P10071 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GLI3P10071 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GLI3P10071 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GLI3P10071 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GLI3P10071 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GLI3P10071 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GLI3P10071 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GLI3P10071 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GLI3P10071 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GLI3P10071 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GLI3P10071 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GLI3P10071 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GLI3P10071 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GLI3P10071 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GLI3P10071 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GLI3P10071 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GLI3P10071 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GLI3P10071 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GLI3P10071 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GLI3P10071 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GLI3P10071 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GLI3P10071 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GLI3P10071 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GLI3P10071 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GLI3P10071 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GLI3P10071 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GLI3P10071 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GLI3P10071 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GLI3P10071 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GLI3P10071 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GLI3P10071 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GLI3P10071 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GLI3P10071 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GLI3P10071 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GLI3P10071 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GLI3P10071 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GLI3P10071 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GLI3P10071 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GLI3P10071 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GLI3P10071 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GLI3P10071 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GLI3P10071 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GLI3P10071 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GLI3P10071 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GLI3P10071 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GLI3P10071 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GLI3P10071 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GLI3P10071 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GLI3P10071 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GLI3P10071 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GLI3P10071 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GLI3P10071 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GLI3P10071 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GLI3P10071 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GLI3P10071 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GLI3P10071 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GLI3P10071 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GLI3P10071 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GLI3P10071 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GLI3P10071 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GLI3P10071 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GLI3P10071 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GLI3P10071 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GLI3P10071 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GLI3P10071 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
GLI3P10071 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GLI3P10071 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GLI3P10071 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GLI3P10071 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GLI3P10071 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GLI3P10071 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms