Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALM2P0DP24 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALM2P0DP24 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms