Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMIM10L2AP0DMW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM10L2AP0DMW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms