Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRGAP2BP0DMP2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRGAP2BP0DMP2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms