Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SP9P0CG40 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SP9P0CG40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP9P0CG40 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms