Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3P1P0C860 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSL3P1P0C860 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms