Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L7P0C7H9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L7P0C7H9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L7P0C7H9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L7P0C7H9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L7P0C7H9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L7P0C7H9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L7P0C7H9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP17L7P0C7H9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L7P0C7H9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L7P0C7H9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms