Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP10P09238 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP10P09238 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP10P09238 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP10P09238 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP10P09238 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP10P09238 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP10P09238 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP10P09238 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP10P09238 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP10P09238 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP10P09238 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP10P09238 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP10P09238 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MMP10P09238 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP10P09238 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MMP10P09238 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MMP10P09238 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MMP10P09238 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMP10P09238 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMP10P09238 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMP10P09238 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMP10P09238 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMP10P09238 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MMP10P09238 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP10P09238 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP10P09238 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP10P09238 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP10P09238 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MMP10P09238 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP10P09238 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP10P09238 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP10P09238 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP10P09238 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP10P09238 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP10P09238 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP10P09238 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MMP10P09238 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
MMP10P09238 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP10P09238 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP10P09238 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP10P09238 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MMP10P09238 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP10P09238 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP10P09238 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP10P09238 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP10P09238 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP10P09238 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP10P09238 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP10P09238 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MMP10P09238 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP10P09238 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP10P09238 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP10P09238 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP10P09238 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP10P09238 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP10P09238 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP10P09238 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP10P09238 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP10P09238 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP10P09238 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP10P09238 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MMP10P09238 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MMP10P09238 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MMP10P09238 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MMP10P09238 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MMP10P09238 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MMP10P09238 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MMP10P09238 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms